🧬 多重配列アラインメント

MAFFT 多重配列アラインメント

GenomeNet MAFFT の画面スタイルを参考にした、ブラウザ内で動く簡易多重配列アラインメントです。実装済みの方法は「Fast progressive」と「Accurate progressive」の2種類に限定し、下に実際の計算手順を明記しています。配列データはブラウザ内のみで処理されます。

📥 配列入力
配列タイプ
配列数: 0   最大長:
⚙️ パラメータ設定
Alignment Settings
Algorithm mode
Scoring matrix
Gap opening penalty
Gap extension penalty
Output order
Output
Output Format
Display Width
📊 解析サマリー
🔬 アラインメント結果
📐 Pairwise identity matrix(%)
🌳 Guide tree(Neighbor-Joining)
Tree layout
Branch length is based on the pairwise distance matrix used for the guide tree. Rooted表示はガイドツリーのrootを左端に置いた矩形表示、Unrooted表示は同じbranch lengthを放射状に配置した表示です。
🖥 配列比較解析はGeneQuickアプリで

サンガーシークエンス解析、配列比較解析を行い、保存可能です。GenBank形式でも保存できます。

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