DNA・タンパク質解析を
ブラウザで、もっと手軽に。

コピーした配列からスペース・改行・数字・FASTAヘッダーなどを除去し、解析しやすい形に整えます。

T→U / U→T を相互変換します。大文字・小文字や区切り文字を自動的に処理します。

DNA配列から逆相補鎖を生成します。プライマー設計・クローニング・アンチセンス鎖の確認に使えます。

DNA/RNA配列をコドン表に基づいて翻訳します。読み枠、ORF自動検出、1文字/3文字表記に対応します。

アミノ酸配列をDNA配列に逆翻訳します。生物種別のコドン使用頻度または手動選択に対応します。

遺伝子名・記号・アクセッション番号から NCBI を検索し、mRNA・タンパク質配列をリアルタイムで取得・コピーできます。

Nearest-Neighbor法でTm・GC%・品質チェックをリアルタイム計算し、PCRプライマー候補を設計します。

点変異、アミノ酸置換、挿入、欠失などを導入するための変異導入プライマーを設計します。

遺伝子名・生物種から ORF と mRNA を自動取得し、Primer-BLAST を開いてプライマーを設計できます。

CRISPick・CRISPOR の比較・案内。ガイドRNA設計とオフターゲット評価ができます。

指定した生物種のコドン使用頻度に基づいてDNA配列を最適化し、変更箇所とGC%変化を表示します。

blastn・blastp・blastx・tblastn・tblastx の5プログラムを解説し、目的に合った NCBI BLAST へ直接アクセスできます。

DNA配列から主要な制限酵素サイトを検索し、切断パターン、突出末端、フラグメントサイズを一覧表示します。

DNA配列のG+C含量を計算し、GCプロファイル、塩基組成、高GC/低GC領域を表示します。

Clustal Omega アルゴリズムによる多重配列アラインメントをブラウザ上で実行。系統樹の可視化にも対応。

ClustalW形式のパラメータで多重配列アラインメントを実行し、行列選択やギャップ補正に対応します。

多重配列アラインメントに同一・類似残基のシェーディングを施し、表示幅や配色を調整できます。

ブラウザ内で動く簡易MAFFTツールです。Fast progressive / Accurate progressive の2種類に対応します。

タンパク質配列中の各アミノ酸の個数と割合を計算し、グラフとテーブルで表示します。

アミノ酸配列からタンパク質の分子量、等電点、アミノ酸組成を計算します。

疎水性を計算し、膜貫通候補領域をPrimary / Secondary candidateとして表示します。

N-X-S/T（X≠P）を検出し、非典型モチーフやProlineによる低効率候補も確認できます。